خلق وهبي جدلا واسعا بعد إعلانه حذف "المرجعية الإسلامية" من مسودة مشروع تعديل المسطرة الجنائية، مبررا ذلك بأن الأخيرة ليس فيها أحكام شرعية مباشرة، وأن المجتمع المغربي يضم مكونات أخرى غير إسلامية.